令人感到十分讽刺的是，假面骑士灭亡迅雷再次成为了人类的敌人。 哉亚日本公司发生了大规模爆炸事件，而罪魁祸首竟然是灭亡迅雷站？面对新闻发布会上记者的质问，刃唯阿表示暂不做任何回应。上级也在不断施压，假面骑士巴尔坎（不破谏）…

零一没有结束——灭亡迅雷站，复活！哉亚公司的ＣＥＯ——里昂 亚克兰德，掳走了灭亡迅雷站的迅。 灭、亡还有雷想要去救迅，却看到了大量的“士兵型修码吉亚”。里昂的目的是大规模生产没有自我意识的“士兵型修码吉亚”，把他们当成武器…

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"灭亡迅雷站的成员——亡正式登场了！本作揭晓了诸多谜团，亡的神秘身份，千骑系统的诞生过程，不破谏大脑中的芯片从何而来……为了打造千骑系统，天津垓指使亡去给灭亡迅雷站送密钥，与灭的接触以及天津垓对待属下的恶劣态度，让亡…