故事发生在遥远的未来，肆虐的异生兽给人类的安全带来了巨大的困扰，为了抵挡异兽的进攻，日本政府成立了防卫组织TLT，其中，夜袭队拥有着最强大的实力和最强劲的武器，是整个组织内部的中坚力量。然而，面对经过了进化的新型异生兽，夜…

在行星布拉姆附近突然出现了一个神秘的人造天体，它吸收了所有的宇宙机器人并制造出了最强的超级机器人军团。为了阻止它，赛罗奥特曼与镜子骑士、红莲火焰和詹伯特联手对敌。

故事发生在与伯利亚银河帝国的战斗结束一年后，塞罗奥特曼在本作中与红莲火焰、镜子骑士、詹伯特阻止天体的运转，并结识了新的伙伴詹奈，他们一起踏上了新的战斗旅程。

最强战士贝利奥斯因为渴望人工太阳火炬的力量而坠入黑暗，但他的叛乱最终被奥特之王平定，并被打进宇宙监狱……多年以后，被扎布拉星人救出的贝利奥斯重回光之国，打败了众奥特战士，成功夺走人工太阳火炬并到怪兽墓场去。失去了火炬的奥…

　　最强战士贝利奥斯因为渴望人工太阳火炬的力量而坠入黑暗，但他的叛乱最终被奥特之王平定，并被打进宇宙监狱。多年以后，被扎布拉星人救出的贝利奥斯重回光之国，打败了众奥特战士，成功夺走人工太阳火炬并到怪兽墓场去。失去了火炬的…

雷等人在收到求救信号后立即前往救援，但却被吸进扭曲空间。在扭曲空间的一颗惑星上，出现了一头机械哥莫拉。原来是莎乐美星人正在进行秘密试验，令所有次元的联系都集结在一起。正当危急之际，赛罗奥特曼出现了。

随着宇宙负能量不断的扩散与增大，M78星云•光之国的宇宙警备队不得不加强了戒备。就在这时，一位邪恶的战士从宇宙监狱的封印中被解放出来，发誓要复仇，并对光之国进行袭击。他夺取了奥特曼战士的生命之源：人工太阳等离子火花的核心，…

塞罗奥特曼在本作中与红莲火焰、镜子骑士、詹伯特阻止天体的运转,并结识了詹奈。